tmnov tutorial : Model 2
Model under a mask
Negative bottom contrast and Water volume reflectance
Lm thresholds
Use the NIR band
return to Calibration 6      next to Bottom Typing
 
 
 
 
Model 2
 
nice -20  ./4SM.4.08 -Process/14_Aug_2011/05_AUG_2011  -OriginFUGRO-NPA                   @@
-DB/tmnov/31_1_0_0/4_1/1265_1559/208.365_2398.755/1_1                            @@      
-Mis/Bahamas/Caicos/Landsat/TM/FUGRO-NPA/UTM_19_008/0.030_0.030/22_NOV_1990                          @@
-LS/0255.0/255.0/255.0/255.0                              @@
-cWL/0.500/0.602/0.500/0.500_AutoCAL                          @@
-M/@000001/00002/00003/00004                              @@
@CP/0000.0/000.0/000.0/000.0_1.52m                          @@
-LsM/199.8/104.0/121.2/099.1_AutoCAL                          @@
-LsM/199.8/108.0/121.2/099.1                              @@
-LsM/219.2/120.0/135.6/111.1_cLM=1.130                      @@
-Lsw/061.0/017.7/011.2/006.9_AutoCAL                        @@
-Lsw/60.42/17.41/10.79/06.50                                  @@
-dLsw000.0/000.8/000.0/000.0                                 @@
-Lw/0009.8/001.5/000.0/000.0_AutoCAL                          @@
-Lw/0010.6/001.5/000.0/000.0                              @@
-Lm/0001.0/001.0/001.0/255.0                              @@
-KK1_2_0.5195/Knir4.500/mask_3_AutoCAL                          @@
@Z/MSL0.00/n_1/RLBgb1.000/mask_3                          @@
-Z/MSL0.00/n_1/RLBgb1.220 /Mask_5                          @@
@Z/MSL0.00/n_1/RLBgb1.090/mask_3                          @@
-B/tclNe/Bmin0/cLM1 .13                              @@
-deglint/vRbaD/GlintM25.0_AutoCAL                      @@
-deglint/vRbaD/GlintM10.0                          @@
@deglint/vRbaD/GlintM00.0                          @@
-extract/v/fullBDH/NIRmax200.0/mBPL4/mask_4                              @@
-calibrate/v/BDSNpZg/BDh_12_13_34                          @@
-Model                                  @@
-Smooth/5/D/Smart+                              @@
@RegressZZv/p/seatruth*depth_points_reproject_pruned/ZM/2_3/0_201/0_30_2.0/*                      @@
@Recode/2_InChannel_5_into_5_OutChannel_5/mask_5               
    

This is to show off a bit :
we shall be able to model under a mask!
-Z/MSL0.00/n_1/RLBgb1.22/Mask_5       
-Model
Next we shall pay attention to mask_4 in Red

-dLsw000.0/000.8/000.0/000.0
-Z/MSL0.00/n_1/RLBgb1.22/mask_4
-dLsw000.0/000.0/000.0/000.0
-Z/MSL0.00/n_1/RLBgb1.09/Mask_4

-dLsw000.0/000.8/000.0/000.0
-Z/MSL0.00/n_1/RLBgb1.22/Mask_4
-dLsw000.0/000.0/000.0/000.0
-Z/MSL0.00/n_1/RLBgb1.09/Mask_4

Why
-dLsw000.0/000.8/000.0/000.0
???
Why
-dLsw000.0/000.0/000.0/000.0
???
 
 
 
 
 
Negative Bottom Contrast 
and
Water Volume Reflectance
Syntax Z

See above that some local areas under mask_4 are assigned to deep water
This is wrong of course
Rather, low light areas deserve special attention
Negative bottom contrast is when Ls-Lsw becomes ~null or even negative

This happens frequently with the Blue bands in "blue" waters 
as Lwblue cannot be disregarded,
Water volume reflectance can reach in excess of 10% in a blue band
-Lw/0010.6/001.5/000.0/000.0

-Z/MSL0.00/N_1/RLBgb1.090/Mask_4
 

WE DON''T WANT THAT!
-Lm/0001.0/001.0/001.0/255.0
-dLsw000.0/000.0/000.0/000.0
-Z/MSL0.00/n_1/RLBgb1.09/Mask_4
n_1 : negative bottom contrast is disabled
 
WE WANT THAT!
-Lm/0001.0/001.0/001.0/255.0
-dLsw000.0/000.0/000.0/000.0
-Z/MSL0.00/N_1/RLBgb1.09/Mask_4
N_1 : negative bottom contrast is enabled

They are very dark-bottomed indeed
just 5 to 15 on a scale of 0 to 200
They are very dark-bottomed indeed
just 5 to 15 on a scale of 0 to 200

Profile_4 is in RED
Profile_4 
RLBgb1.09
 

We want more bottom reflected photons to reach the sensor!
nice -20  ./4SM.4.08 -Process/14_Aug_2011/05_AUG_2011  -OriginFUGRO-NPA                @@
-DB/tmnov/31_1_0_0/4_1/1265_1559/208.365_2398.755/1_1                               @@
-Mis/Bahamas/Caicos/Landsat/TM/FUGRO-NPA/UTM_19_008/0.030_0.030/22_NOV_1990                       @@
-LS/0255.0/255.0/255.0/255.0                           @@
-cWL/0.500/0.602/0.500/0.500_AutoCAL                       @@
-M/@000001/00002/00003/00004                           @@
@CP/0000.0/000.0/000.0/000.0_1.52m                       @@
-LsM/199.8/104.0/121.2/099.1_AutoCAL                       @@
-LsM/199.8/108.0/121.2/099.1                           @@
-LsM/219.2/120.0/135.6/111.1_cLM=1.130                   @@
-Lsw/061.0/017.7/011.2/006.9_AutoCAL                     @@
-Lsw/60.42/17.41/10.79/06.50                               @@
-dLsw000.0/000.0/000.0/000.0                              @@
-Lw/0009.8/001.5/000.0/000.0_AutoCAL                       @@
-Lw/0010.6/001.5/000.0/000.0                           @@
-Lm/0001.0/001.0/001.0/255.0                           @@
-KK1_2_0.5195/Knir4.500/mask_3_AutoCAL                       @@
@Z/MSL0.00/n_1/RLBgb1.000/mask_3                       @@
-Z/MSL0.00/n_1/RLBgb1.09 /Mask_4                       @@
@Z/MSL0.00/n_1/RLBgb1.090/mask_3                       @@
-B/tclNe/Bmin0/cLM1 .13                           @@
-deglint/vRbaD/GlintM25.0_AutoCAL                   @@
-deglint/vRbaD/GlintM10.0                       @@
@deglint/vRbaD/GlintM00.0                       @@
-extract/v/fullBDH/NIRmax200.0/mBPL4/mask_4                           @@
-calibrate/v/BDSNpZg/BDh_12_13_34                       @@
-Model                               @@
-Smooth/5/D/Smart+                           @@
@RegressZZv/p/seatruth*depth_points_reproject_pruned/ZM/2_3/0_201/0_30_2.0/*                   @@
@Recode/2_InChannel_5_into_5_OutChannel_5/mask_5               
 
 
 
 



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